Come tutti gli investimenti, anche i certificates a capitale protetto possono andare incontro a qualche rischio, anche se in minima misura. Il primo rischio è quello emittente, dato dalla passività che questi certificati rappresentano. In questo caso si rischia il default, anche se è un evento molto raro. Il secondo rischio è invece rappresentato dalla possibile mancanza di quotazione in borsa dei certificates, che potrebbe in alcuni casi significare una mancanza di liquidità ed un prezzo alto da pagare in termini di differenziale tra costo e guadagno.